Repertuar Morphing Vienna Chamber Orchestra w zasadzie nie ma ograniczeń, ma rozpiętość od Mozarta do muzyki współczesnej, a także rozrywkowej i filmowej.

W 2008 roku w zbiorach muzycznych zgromadzonych w Klasztorze Jasnogórskim odnaleziono 18 partytur sygnowanych nazwiskiem Mozarta. Morphing Vienna Chamber Orchestra podjęła się prawykonania tych utworów. Pierwsze wykonanie arii „Jesu dulcis memoria” na sopran solo, klarnet i orkiestrę kameralną miało miejsce w czasie Międzynarodowego Festiwalu Muzyki Sakralnej Gaude Mater w Częstochowie. Orkiestra planuje wykonanie i nagranie pozostałych partytur sygnowanych nazwiskiem Mozarta.